Sam Fisher Sam Fisher è il principale agente operativo della Third Echelon. Fisher è stato in prima linea nello spionaggio per diversi anni. Non solo è riuscito a sopravvivere ma è anche diventato il più esperto agente operativo grazie al suo duro lavoro, alla sua incredibile curiosità e onestà. Non ha tempo per le sottigliezze e ancora meno per le bugie.
	Irving Lambert Irving Lambert è il collegamento tra l'agente operativo (o gli agenti) e il team di ricercatori, hacker, strateghi e comandanti di Third Echelon. E' la principale fonte di informazione per Fisher attraverso il suo comunicatore. Istruisce Fisher sugli obiettivi che devono essere portati a termine in ogni missione. Quando un ulteriore personaggio deve istruire Fisher su un compito specifico, è sempre Lambert a introdurlo.
	Anna Grimsdottir Attraverso il comunicatore, Grímsdóttir istruisce Fisher sui dispositivi tecnologici che potrà incontrare durante le missioni.
	Suhadi Sadono Suhadi Sadono, guerrigliero indonesiano che è riuscito a guadagnarsi con il suo carisma una grossa schiera di seguaci e che ora tiene in scacco gli Stati Uniti con la minaccia di un attacco batteriologico
	Norman Soth Norman Soth, un mercenario originariamente addestrato dalla CIA, appositamente per le campagne nel Sud Est asiatico, ma in seguito sfuggito dal controllo del proprio Pigmalione.
	Dahlia Tal Dahlia Tal è un agente dello Shin Bet, la polizia segreta israeliana, dalla personalità ben più determinata delle due appena viste, esperta in interrogatori, pubbliche relazioni e spionaggio.
	Douglas Shetland Douglas Shetland, CEO della Displace International, una società privata che si occupa di sicurezza, spesso assoldata dallo stesso governo U.S.A., è un ex ingegnere ed al contempo un ex marine, ritiratosi nel settore della difesa privata dopo essere stato sacrificato come un capro espiatorio dai propri superiori.